中科院三亚深海科学与工程研究所科研园区坐落于鹿回头西北角，为中科院南海海洋所海南热带海洋生物实验站原址。

2011年年初在中科院党组第一次会议上，中科院党组面向国家需求，力图填补我国南海海域研究的空白，决定在三亚设立研究机构——三亚深海所，其选址在南海海洋所的海南热带海洋生物实验站。为落实中科院党组的决定，2011年三亚深海所筹建组就入驻三亚，开始了前期的筹建工作，重点是启动科研园区的基建工作。

经过一年多的努力，三亚深海所的基建工作在重重的困难中取得了重大突破。2012年5月三亚深海所成立了由筹建组副组长代亮牵头，以综合办公室主任张忠为组长的交接工作组。在与南海海洋所、海南热带海洋生物实验站相关负责人多次友好协商后，双方就搬迁、赔偿等相关事宜达成了共识，并签署了《科研园区交接工作备忘录》。2012年7月13日，交接工作顺利完成。

科研园区交接工作的完成，使三亚深海所正式入驻科研园区，并开始独立管理园区，这标志着三亚深海所科研园区的基建工作迈进了一大步，为后续的园区建设工作奠定了基础。