FISH-TAMB,一种无需固定细胞的mRNA 荧光标记技术

  近期地外海洋系统研究室刘翠艳研究员作为共同通讯作者在微生物生态学期刊Microbial Ecology上在线发表论文一篇,题为 FISH-TAMB, a Fixation-Free mRNA Fluorescent Labeling Technique to Target Transcriptionally Active Members in Microbial Communities。研究人员开发了一种适用于标记古菌和细菌的信使RNA(mRNA)的荧光原位杂交(FISH)技术。FISH-TAMB 方法与现有 FISH 方法的不同之处在于缓冲液中不含固定剂或表面活性剂,在目标细胞的生长温度下杂交时间短至 15 分钟,并且省略了洗涤步骤。论文详细地介绍了 FISH-TAMB 的制备和应用例子。通过对(1) 表达产甲烷菌 Methanosarcina barkeri mcrA基因的大肠杆菌; (2) M. barkeri;和(3) 来自深部大陆钻孔的厌氧甲烷营养 (ANME) 富集培养,证明了FISH-TAMB 标记细胞内 mRNA 靶标、区分转录状态、检测活跃和稀有分类群以及保持细胞活力的能力。FISH-TAMB 具有多复用和可应用于16S rRNA的潜力,在环境微生物学领域具有潜在的广泛应用。 

 

    

FISH-TAMB探针构象及与信使RNA杂交过程(Harris, Lau et al. 2021) 

    

  原文链接: 

  https://link.springer.com/article/10.1007/s00248-021-01809-5