构建有潜在高亲和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-变形杆菌(USCα)的基因
近日,地外海洋系统研究室与普林斯顿大学地球科学系Tullis C. Onstott教授研究团队合作在国际期刊《Microbiology Resource Announcements》上发表了题为“Metagenome-Assembled Genome of USCα AHI, a Potential High-Affinity Methanotroph from Axel Heiberg Island, Canadian High Arctic”的论文。深海所刘翠艳研究员为通讯作者。
该研究团队在2011-2013年期间在加拿大北极高地海伯格岛(Axel Heiberg Island;AHI)检测到含低碳的冻土夏季时分是甲烷汇,并在2015-2016年报道了AHI融冻层含活跃的微生物,负责氧化空气中低甲烷浓度的微生物丰度非常低(~1%)。不过,这些高亲和力的甲烷氧化菌未被培养和分离。
本研究从21个融冻层的实验样品提取的宏基因组数据,通过拼接手法,构建了有潜在高亲和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-变形杆菌(USCα)的基因组,从而揭示其生理和生长需要。
拜叶林克氏菌科甲烷氧化菌与USCα AHI的基因组比较(Rusley et al.,2019)
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